用戶:Alexis Zhang/沙盒/蒺藜苜蓿

蒺藜苜蓿
保護狀況
	; 無危（IUCN 3.1）
科學分類
界：	植物界 Plantae
演化支：	維管束植物 Tracheophyta
演化支：	被子植物 Angiosperms
演化支：	真雙子葉植物 Eudicots
演化支：	薔薇類植物 Rosids
目：	豆目 Fabales
科：	豆科 Fabaceae
亞科：	蝶形花亞科 Faboideae
屬：	苜蓿屬 Medicago
種：	蒺藜苜蓿 M. truncatula
二名法
	Medicago truncatula; Gaertn.
異名
	Medicago tribuloides Desr.; Medicago tribuloides var. breviaculeata Moris; Medicago truncatula var. breviaculeata (Moris) Urb.; Medicago truncatula var. longiaculeata Urb.; Medicago truncatula var. tribuloides (Desr.) Burnat; Medicago truncatula f. tricycla Nègre; Medicago truncatula var. tricycla (Nègre) Heyn

蒺（ㄐㄧˊ）藜（ㄌㄧˊ）苜（ㄇㄨˋ）蓿（ㄙㄨˋ）（學名：Medicago truncatula）為一年生莢果植物，原產於地中海地區。可用於基因組研究。其植株低矮，呈三葉草狀，高10至60 公分，有三片圓形葉。葉長1至2 公分，中心通常有一個黑點。花是黃色的，單生或兩到五個花序生；果實是一個小的多刺莢。

由於該物種具有小的二倍體基因組，有自育能力，生長時間短，種子產量高，易於遺傳轉化，並已對其基因組進行了測序，因此它被認為是豆科生物學的模式生物^[2]。

它可以與固氮根瘤菌或叢枝菌根真菌（包括不規則根瘤菌）形成共生體。又因模式植物擬南芥不會與上述真菌形成共生關係，這使它成為研究這些過程的重要工具。

它也是澳大利亞重要的飼料作物。

基因組測序

2011年，《自然》雜誌發表了蒺藜苜蓿A17品種的基因組序列草案^[2]。

該測序工作由研究實驗室的國際合作夥伴進行，其研究人員來自奧克拉荷馬大學（美國），克雷格·文特爾研究所（美國），法國國家測序中心（法國），以及維康桑格研究所（英國）。合作機構包括明尼蘇達大學（美國）,加利福尼亞大學戴維斯分校（美國）,國家基因組資源中心（美國），約翰·英尼斯中心（英國），國立農學研究所（法國），慕尼黑蛋白質序列信息中心（德國），瓦赫寧恩大學（荷蘭），以及根特大學（比利時）。Medicago truncatula測序協會始於2001年塞繆爾·羅伯茨·諾布爾基金會的種子撥款。2003年，國家科學基金會和歐盟第六框架計劃，開始提供大部分資金。到2009年，已經完成了84％的基因組組裝^[3]。

其基因組序列的組裝，以細菌人工染色體（BACs）為載體。這與對人類、黑腹果蠅和擬南芥的基因組測序方法相同。 2013年7月，該基因組的4.0版發佈^[4] 。該版本結合了鳥槍法獲得的序列與基於BAC的序列集，有助於填補先前映射序列中的空白。

與此同時，國際苜蓿基因註釋小組（IMGAG）負責識別和描述基因組序列中的推定基因序列。

拓展閱讀

基因組學

參考資料

^ Rhodes, L. Medicago truncatula. The IUCN Red List of Threatened Species (IUCN). 2016, 2016: e.T176489A19401776. doi:10.2305/IUCN.UK.2016-3.RLTS.T176489A19401776.en.
^ ^2.0 ^2.1 Young, Nevin D.; Debellé, Frédéric; Oldroyd, Giles E. D.; Geurts, Rene; Cannon, Steven B.; Udvardi, Michael K.; Benedito, Vagner A.; Mayer, Klaus F. X.; Gouzy, Jérôme; Schoof, Heiko; Van de Peer, Yves; Proost, Sebastian; Cook, Douglas R.; Meyers, Blake C.; Spannagl, Manuel; Cheung, Foo; De Mita, Stéphane; Krishnakumar, Vivek; Gundlach, Heidrun; Zhou, Shiguo; Mudge, Joann; Bharti, Arvind K.; Murray, Jeremy D.; Naoumkina, Marina A.; Rosen, Benjamin; Silverstein, Kevin A. T.; Tang, Haibao; Rombauts, Stephane; Zhao, Patrick X.; Zhou, Peng; Barbe, Valérie; Bardou, Philippe; Bechner, Michael; Bellec, Arnaud; Berger, Anne; Bergès, Hélène; Bidwell, Shelby; Bisseling, Ton; Choisne, Nathalie; Couloux, Arnaud; Denny, Roxanne; Deshpande, Shweta; Dai, Xinbin; Doyle, Jeff J.; Dudez, Anne-Marie; Farmer, Andrew D.; Fouteau, Stéphanie; Franken, Carolien; Gibelin, Chrystel; Gish, John; Goldstein, Steven; González, Alvaro J.; Green, Pamela J.; Hallab, Asis; Hartog, Marijke; Hua, Axin; Humphray, Sean J.; Jeong, Dong-Hoon; Jing, Yi; Jöcker, Anika; Kenton, Steve M.; Kim, Dong-Jin; Klee, Kathrin; Lai, Hongshing; Lang, Chunting; Lin, Shaoping; Macmil, Simone L.; Magdelenat, Ghislaine; Matthews, Lucy; McCorrison, Jamison; Monaghan, Erin L.; Mun, Jeong-Hwan; Najar, Fares Z.; Nicholson, Christine; Noirot, Céline; O』Bleness, Majesta; Paule, Charles R.; Poulain, Julie; Prion, Florent; Qin, Baifang; Qu, Chunmei; Retzel, Ernest F.; Riddle, Claire; Sallet, Erika; Samain, Sylvie; Samson, Nicolas; Sanders, Iryna; Saurat, Olivier; Scarpelli, Claude; Schiex, Thomas; Segurens, Béatrice; Severin, Andrew J.; Sherrier, D. Janine; Shi, Ruihua; Sims, Sarah; Singer, Susan R.; Sinharoy, Senjuti; Sterck, Lieven; Viollet, Agnès; Wang, Bing-Bing; Wang, Keqin; Wang, Mingyi; Wang, Xiaohong; Warfsmann, Jens; Weissenbach, Jean; White, Doug D.; White, Jim D.; Wiley, Graham B.; Wincker, Patrick; Xing, Yanbo; Yang, Limei; Yao, Ziyun; Ying, Fu; Zhai, Jixian; Zhou, Liping; Zuber, Antoine; Dénarié, Jean; Dixon, Richard A.; May, Gregory D.; Schwartz, David C.; Rogers, Jane; Quétier, Francis; Town, Christopher D.; Roe, Bruce A. The Medicago genome provides insight into the evolution of rhizobial symbioses. Nature. 16 November 2011, 480 (7378): 520–524. PMID 22089132. doi:10.1038/nature10625.
^ http://www.medicago.org/genome/genome_stats.php^{[永久失效連結]}
^ JCVI: Medicago / Home. [20 February 2017]. （原始內容存檔於10 November 2013）.

參考文獻

Courty, Pierre Emmanuel; Smith, Penelope; Koegel, Sally; Redecker, Dirk; Wipf, Daniel. Inorganic Nitrogen Uptake and Transport in Beneficial Plant Root-Microbe Interactions. Critical Reviews in Plant Sciences. 1 June 2015, 34 (1–3): 4–16. doi:10.1080/07352689.2014.897897.

外部連結

The Medicago truncatula Consortium
Medicago truncatula Hapmap Project
TIGR's link to Genome Browser and Gene Index
The Medicago Gene Expression Atlas at Samuel Roberts Noble Foundation
Medicago truncatula eFP Browser Viewer for gene expression data from the Medicago Gene Expression Atlas project, at the Provart Lab's Bio-Array Resource website
INRA Medicago truncatula Stock Center – France
Choi, Hong-Kyu; Mun, Jeong-Hwan; Kim, Dong-Jin; Zhu, Hongyan; Baek, Jong-Min; Mudge, Joanne; Roe, Bruce; Ellis, Noel; Doyle, Jeff; Kiss, Gyorgy B.; Young, Nevin D.; Cook, Douglas R. Estimating genome conservation between crop and model legume species. Proceedings of the National Academy of Sciences. 26 October 2004, 101 (43): 15289–15294. doi:10.1073/pnas.0402251101.
Young, Nevin D.; Cannon, Steven B.; Sato, Shusei; Kim, Dongjin; Cook, Douglas R.; Town, Chris D.; Roe, Bruce A.; Tabata, Satoshi. Sequencing the Genespaces of Medicago truncatula and Lotus japonicus. Plant Physiology. 1 April 2005, 137 (4): 1174–1181. doi:10.1104/pp.104.057034.
NCGR
European Research Programmes on the model legume Medicago truncatula
Why sequence medicago truncatula?

[iucn-1] Rhodes, L. Medicago truncatula. The IUCN Red List of Threatened Species (IUCN). 2016, 2016: e.T176489A19401776. doi:10.2305/IUCN.UK.2016-3.RLTS.T176489A19401776.en.

[Young-2] 2.0 ^2.1 Young, Nevin D.; Debellé, Frédéric; Oldroyd, Giles E. D.; Geurts, Rene; Cannon, Steven B.; Udvardi, Michael K.; Benedito, Vagner A.; Mayer, Klaus F. X.; Gouzy, Jérôme; Schoof, Heiko; Van de Peer, Yves; Proost, Sebastian; Cook, Douglas R.; Meyers, Blake C.; Spannagl, Manuel; Cheung, Foo; De Mita, Stéphane; Krishnakumar, Vivek; Gundlach, Heidrun; Zhou, Shiguo; Mudge, Joann; Bharti, Arvind K.; Murray, Jeremy D.; Naoumkina, Marina A.; Rosen, Benjamin; Silverstein, Kevin A. T.; Tang, Haibao; Rombauts, Stephane; Zhao, Patrick X.; Zhou, Peng; Barbe, Valérie; Bardou, Philippe; Bechner, Michael; Bellec, Arnaud; Berger, Anne; Bergès, Hélène; Bidwell, Shelby; Bisseling, Ton; Choisne, Nathalie; Couloux, Arnaud; Denny, Roxanne; Deshpande, Shweta; Dai, Xinbin; Doyle, Jeff J.; Dudez, Anne-Marie; Farmer, Andrew D.; Fouteau, Stéphanie; Franken, Carolien; Gibelin, Chrystel; Gish, John; Goldstein, Steven; González, Alvaro J.; Green, Pamela J.; Hallab, Asis; Hartog, Marijke; Hua, Axin; Humphray, Sean J.; Jeong, Dong-Hoon; Jing, Yi; Jöcker, Anika; Kenton, Steve M.; Kim, Dong-Jin; Klee, Kathrin; Lai, Hongshing; Lang, Chunting; Lin, Shaoping; Macmil, Simone L.; Magdelenat, Ghislaine; Matthews, Lucy; McCorrison, Jamison; Monaghan, Erin L.; Mun, Jeong-Hwan; Najar, Fares Z.; Nicholson, Christine; Noirot, Céline; O』Bleness, Majesta; Paule, Charles R.; Poulain, Julie; Prion, Florent; Qin, Baifang; Qu, Chunmei; Retzel, Ernest F.; Riddle, Claire; Sallet, Erika; Samain, Sylvie; Samson, Nicolas; Sanders, Iryna; Saurat, Olivier; Scarpelli, Claude; Schiex, Thomas; Segurens, Béatrice; Severin, Andrew J.; Sherrier, D. Janine; Shi, Ruihua; Sims, Sarah; Singer, Susan R.; Sinharoy, Senjuti; Sterck, Lieven; Viollet, Agnès; Wang, Bing-Bing; Wang, Keqin; Wang, Mingyi; Wang, Xiaohong; Warfsmann, Jens; Weissenbach, Jean; White, Doug D.; White, Jim D.; Wiley, Graham B.; Wincker, Patrick; Xing, Yanbo; Yang, Limei; Yao, Ziyun; Ying, Fu; Zhai, Jixian; Zhou, Liping; Zuber, Antoine; Dénarié, Jean; Dixon, Richard A.; May, Gregory D.; Schwartz, David C.; Rogers, Jane; Quétier, Francis; Town, Christopher D.; Roe, Bruce A. The Medicago genome provides insight into the evolution of rhizobial symbioses. Nature. 16 November 2011, 480 (7378): 520–524. PMID 22089132. doi:10.1038/nature10625.

[3] ttp://www.medicago.org/genome/genome_stats.php^{[永久失效連結]}

[4] JCVI: Medicago / Home. [20 February 2017]. （原始內容存檔於10 November 2013）.

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