鄰近連接法
鄰接法（英文：neighbor-joining method；又稱 NJ 法），生物信息學術語，是一種用於構建系統發生樹（演化樹）的快速聚類方法，由日本遺傳學家齋藤成也（平文式羅馬字：Saitou Naruya）和日裔美國生物學家根井正利（Nei Masatoshi）二人在1987年創立[2]。使用鄰接法構建演化樹時，通常需要基於 DNA 序列或蛋白質數據，以此了解每對分類單元之間的距離，通過確定距離最近（或相鄰）的成對分類單元使演化樹的總距離達到最小，循環地將相鄰點合併成新的點，最終形成完整的樹型[3][4]。
鄰接法不需要關於分子鐘的假設，不考慮任何優化標準，基本思想是進行類的合併時，不僅要求待合併的類是相近的，而且要求待合併的類遠離其他的類，從而通過對完全沒有解析出的星型演化樹進行分解，來不斷改善星型演化樹[5]。
參閱
[編輯]參考文獻
[編輯]
- ^ モンゴロイドの形成. 九州大學総合研究博物館.（日語）
- ^ Saitou, N. & Nei, M. The neighbor-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees. Molecular Biology and Evolution. 1987-07-01, 4 (4): 406–425 [2020-09-19]. PMID 3447015. doi:10.1093/oxfordjournals.molbev.a040454
. 原始內容存檔於2014-12-25.
- ^ Didelot, Xavier. "Sequence-Based Analysis of Bacterial Population Structures". Robinson, D. Ashley; Falush, Daniel & Feil, Edward J (編). Bacterial Population Genetics in Infectious Disease. Hoboken, NJ: John Wiley and Sons. 2010: 46–47 [2021-07-02]. ISBN 978-0-470-42474-2. （原始內容存檔於2021-07-25）.
- ^ 第二屆植物學名詞審定委員會 (編). 植物学名词 (2版). 北京: 科學出版社. 2019 [2021-10-23]. ISBN 978-7-03-062178-8. （原始內容存檔於2021-10-23）.（簡體中文）
- ^ 古生物學名詞審定委員會 (編). 古生物学名词 (2版). 北京: 科學出版社. 2009 [2021-10-23]. ISBN 978-7-03-025433-7. （原始內容存檔於2021-10-23）.（簡體中文）
外部連結
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