染色體工程（chromosome engineering）指的是按照人為的設計，有計劃的消去、增添或替換同種或異種的染色體，從而使遺傳性狀發生定向改變、選育新品種的一種技術。主要技術包括：多倍體育種、單倍體育種、雌核發育和雄核發育、染色體顯微操作、染色體微克隆以及染色體轉移等技術。
